当前我省农村环境保护形式严峻，饮用水源污染、农村生活污染、面源污染、畜禽养殖污染严重，工业污染、城市污染向农村转移，农村环境质量日趋恶化，这些问题与构建和谐、文明的社会主义新农村的要求不相适应，已成为农村社会经济可持续发展的制约因素。我省又是边疆、少数民族省份，处于多条国际和国内河流的上游，是中下游地区重要的生态安全屏障，农村环境污染问题也影响到边疆的稳定和下游地区的生态安全，必须引起高度重视。
开展村庄环境综合整治，是实现城乡统筹的重要环节，是建设社会主义新农村的核心内容之一。有利于加强村镇基础设施建设，完善村镇服务功能，改善村容镇貌，提升农村人居环境和农村社会文明；有利于农业的健康发展和农村的和谐稳定；有利于提高广大农民生活质量和健康水平；有利于边疆的稳定和下游地区的生态安全；有利于社会主义新农村建设目标的实现。对促进我省农村走上生产发展、生活富裕、生态良好、人与自然和谐发展道路具有重大意义。
2指导思想、原则和目标
2.1指导思想
以科学发展观为指导，以建设“清洁水源、清洁田园、清洁家园”的社会主义新农村为目标，在积极落实国家农村环境保护有关精神和政策的同时，结合云南省农村环保实际，以切实解决严重危害群众身体健康的突出环境问题、改变农村环保落后状况为基本出发点，坚持以人为本、环保为民，促进城乡和谐发展，以试点示范为先导，以湖泊水库流域农村环境治理为重点，努力建设生产发展、资源节约、环境友好的社会主义新农村，为全面
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建设小康社会提供环境安全保障。
2.2基本原则
（1）以奖促治，逐步推进。针对严重危害农村居民健康、群众反映强烈的突出污染问题，采取有力措施集中进行整治，对经过整治、污染问题得到解决的村庄，进行“奖励”，逐步引导广大农村地区环境保护和综合治理工作全面展开。
（2）依托村庄，务求实效。各类问题的治理以村庄作为基本单元，通过综合措施运用和资金集中投入，力求较短时间内有效解决村庄饮水安全、生活污水和垃圾处理、畜禽养殖污染等突出问题，改善村庄环境状况。
（3）统筹安排，突出重点。农村环境问题成因复杂，许多历史遗留问题难以在短期内解决，必须进行近远期、区域间的统筹规划，优先解决影响面大、矛盾突出的问题，分步实施，逐步推进。积极探索适合不同区域特点的治理经验与技术，不断提高治理成效。优先考虑解决群众反映强烈、问题比较集中地区的农村环境问题，特别是危害群众健康最为直接的饮水安全、工农业生产污染、生活污染问题。
（4）政府扶持，多方筹资。农村环境综合整治涉及面广、问题复杂，需要大量治理资金的投入。应坚持申报上级财政投入外，项目所在地政府还应自筹部分资金，同时要组织动员农民以投工投劳等形式参与到建设中，以切实保障重点村庄的环境治理成效。
2.3规划时限
规划期为2009-2015年，分为第一期（2009-2010年）和第
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二期（2011-2015年）两个阶段。
2.4规划目标
第一期（2009~2010年）目标：利用2年左右时间，集中治理一批环境问题最为突出、当地群众反映最为强烈的村庄，使重点区域、流域污染直排村及其它区域的部分村庄的环境状况明显好转，使畜禽污染得到有效治理，农业面源污染防治取得一定进展，农村环境健康危害得到有效控制，农村工业污染防治取得初步成效，农村环境监管能力得到加强，农民生产环境和人居环境有所改善。
第二期（2011~2015年）目标：再利用5年左右时间，使全省环境问题比较突出、严重危害群众健康的村庄治理数量进一步增加，力争使重点流域、区域村庄环境状况获得整体改善，其它区域大部分村庄的环境状况获得明显改善。
2.5具体指标
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