科学与宗教关系及其历史演变（钱时惕） 波爱修斯（boethius 480—525）最早把亚里士多德的逻辑介绍到欧洲，并创立假言和选言推理，丰富了三段论；格罗塞特撰写了《分析后篇》(亚里士多德的逻辑学作品)的注解，提出了否定后件推理；布里丹 深入研了形式推理与实质推力的关系；约翰.邓。司各脱与奥卡姆得威廉则各自提出归纳求同法和归纳差异法，并把方法应用羽科学研究。
给予理性基础的怀疑精神，在经院哲学内部形成了反正同神学的种种流派。其中对自然思维方式影响较大的的有：
1， 爱克哈特（1260—1372）的泛神论 2， 威廉·奥卡姆（1285—1349）的“剃刀” 3， 库萨的尼古拉（1401—1464）的宇宙论
尼古拉认为宇宙是单一的，它不为任何其他的宇宙所限制因此，宇宙从空间上说是无限的。宇宙没有任何确定的中心，既然没有中心，因而也就没有“在上”与“在下”之说。地球不是宇宙的中心，因此不能没有运动。尼古拉的无限宇宙论远早于哥白尼、布鲁诺的思想。
正是基于这种怀疑精神，使得哥白尼、布鲁诺、伽利略（对教会推崇地心说的怀疑）、萨维留斯、塞尔维特、哈维（对教会支持的盖仑三灵气说的怀疑）、达尔文、华莱士、赫胥黎（对神创论的怀疑）。。。等走上了“反叛”基督教神学、创立新的自然科学学说之路。
十二世纪兴办的一系列著名大学：巴黎大学（1100）、波伦亚大学
（1100）、牛津大学（1168）、剑桥大学（1209）、帕多亚大学（1222）、布拉格大学（1348）、维也纳大学（1365）、科隆大学（1388）、莱比锡大学（1409）等，都是在教会的主持或允许下兴办的。教会在不违背教条的情况下，还是很重视教育的。
四 围绕日心说与地心说之争，科学与基督教神学的激烈冲突
日心说与地心说之争：日心说模型最早是由毕达哥拉斯学派的菲洛劳斯（约公元前450—公元前400）所提出的“宇宙中心火学说”：宇宙中心是一团熊熊燃烧的烈火，其他星球都围绕着中心火旋转。后来的阿里斯塔克（公元前310—公元前230）更加明确的提出了“太阳是宇宙的中心”的学说。他认为太阳是静止的，地球和其他五个的星球都围绕太阳为中心做圆周运动。阿里斯塔克的著作出《轮太阳与地球的大小和距离》一书外，其余均流失。约一个世纪以后，巴比伦的塞留库斯（约公元前150）对阿里斯塔克的观点做了详细的论述。
地心说的西方渊源：由托勒密提出一套完整的理论体系。《至大论》（又名《伟大论》，原名《数学综合论》）托勒密的理论吸收了阿波罗尼（公元前150—公元前205）、西帕哈斯（公元前150左右）、亚里士多德的有关概念，建立了以地球为中心，太阳围绕地球按照本轮、均轮体系运动的天体模型。在基督教看来，人是上帝根据自己的形象塑造的二日月星辰则是上帝为了人类而创造的。因此人居住的地方理应成为在宇宙的中心。这种观点，与托勒密的地心说实相符的。基督教思想与托勒密理论的结合，就形成了“地球在宇宙的中心，上有天堂，下有地狱“的构想，
这正是中世纪末日审判的图画；再加上《圣经》上所谓：约书亚摇太阳停止而不是地球停止”的故事以及赞美“将大地置于它牢固的基础上，使其不得移动”的诗句；托勒密的学说被纳入基督教思想体系中。 哥白尼的宇宙模型:《天体运行论》一书与1515年完成，1543年初版，期间托了28年，原因有两个。其一，哥白尼估计有人 “会摘引圣经中的章句加以曲解来对我的著作进行非难的攻击”,因此而有所犹豫；其二是哥白尼对于自己的理论不能与观测结果完全取得一致而不满，总想做进一步的改进。
在其模型中，太阳处于宇宙的中心，它照亮整个宇宙，驾驭着周围的行星，地球一方面自转，一方面与其他行星一道围绕太阳运动，最外层则是宇宙之边—恒星天。
恩格斯指出，“自然科学借以宣布其独立并且好像是重演路德焚毁教谕的革命行动，便是哥白尼那本不朽著作的出版，他用这本书来向自然事物的教会权威挑战。从此自然科学便开始从神学中解放出来。” 布鲁诺，伽利略对哥白尼学说的宣传和发展：布鲁诺（1548—1600）出生于意大利南部的小镇诺拉，1565年进入圣多米尼克修道院。1584年<<轮无限、宇宙语众世界>>一书出版，其中他的观点主要是：他认为哥白尼所描绘的太阳系在宇宙中不止一个，而是无限个。布鲁诺指出：“不可计数的恒星是许许多多格世界，甚至比我们这个世界还大，要说它们他们是无目的的，无终极原因地仅同我们这个世界有那么一点点的联系，那是没有任何根据的。”1600年，布鲁诺被罗马宗教裁判所地位诶“异端分子”而被活活烧死在百花广场。
伽利略：1564年出生于意大利的比萨，早年在卡马多斯修道院学习，并加入修道会。在大学期间，伽利略开始学习医学，后转向物理学。1589年任比萨大学数学及天文学教授。1619年，德国天文学家开普勒出版了《宇宙谐论》一书，总结了行星运动的三大定律。抛弃了繁杂的本轮均轮体系，纠正了行星运动限于匀速、圆周的概念，是哥白尼的学说更加完整。1632年，《关于托勒密和哥白尼两大世界体系的对话》出版，伽利略因此受审。1633年6约22日，判定伽利略为重大“异端”嫌疑，处以终身监禁。历史总是无情的，宗教对科学的禁锢、迫害，阻挡不了科学的发展。1687年，牛顿等发现了万有引力定律，为行星围绕太阳的运动找到了科学的依据，是日心说有一次获得重大胜利。1838
年，贝
塞尔（1784—1846）从观测中证实了恒星视差之存在，驳倒了地心说
最后的一道王牌。到1882年，基督教会被迫承认日心说。1979年，罗马教会宣布要重申伽利略案件，胫骨13年的复查，认定伽利略的学说并非异端，1992年10约31 日，正式为伽利略平反。
机械自然观形成时期科学与宗教的关系
（一）机械自然观之形成及其意义
自然科学经过伽利略、第谷、开普勒、笛卡尔
（1596—1650）、胡克（1635—1702）等人出色工作，导致牛顿《自然哲学的数学原理》一书的出版，完成了物质世界
的第一次伟大综合 。
牛顿工作的伟大意义在于：（1）证明了地上的运动规律与天上的运动规律是统一的，从而破除了古希腊与中世纪以为天体具有特殊的或神圣性